建設農村沼氣工程，選擇地基是非常重要的，地基的選擇直接影響了沼氣工程的質量及使用壽命的問題。

因爲農村沼氣工程沼氣池是埋于地下的建築物，所以與土質好壞關系很大，土質不同密度不同，堅實底當然也不同，例如，土層松軟或沙性土再或者地下水位較高的爛泥土，所以對應池基承載力不夠而會引起池體沉降或發生不均勻沉降，而導致沼氣工程的使用故障，例如池體破裂，漏水漏氣的狀況。